Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SEMA3AQ14563 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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SEMA3AQ14563 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SEMA3AQ14563 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SEMA3AQ14563 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SEMA3AQ14563 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SEMA3AQ14563 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SEMA3AQ14563 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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SEMA3AQ14563 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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