Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMB3Q13751 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms