Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PEX6Q13608 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms