Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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TOP3AQ13472 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TOP3AQ13472 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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TOP3AQ13472 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TOP3AQ13472 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TOP3AQ13472 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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