Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLAMF1Q13291 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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