Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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NR1H3Q13133 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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NR1H3Q13133 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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NR1H3Q13133 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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NR1H3Q13133 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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NR1H3Q13133 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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NR1H3Q13133 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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NR1H3Q13133 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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NR1H3Q13133 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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NR1H3Q13133 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1H3Q13133 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
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