Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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