Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms