Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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RASGEF1BQ0VAM2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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RASGEF1BQ0VAM2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RASGEF1BQ0VAM2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RASGEF1BQ0VAM2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RASGEF1BQ0VAM2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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