Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LTBQ06643 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LTBQ06643 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LTBQ06643 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LTBQ06643 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LTBQ06643 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LTBQ06643 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LTBQ06643 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LTBQ06643 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LTBQ06643 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LTBQ06643 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LTBQ06643 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LTBQ06643 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LTBQ06643 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LTBQ06643 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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LTBQ06643 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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LTBQ06643 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LTBQ06643 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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LTBQ06643 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTBQ06643 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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LTBQ06643 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTBQ06643 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LTBQ06643 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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LTBQ06643 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LTBQ06643 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LTBQ06643 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LTBQ06643 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LTBQ06643 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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