Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms