Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYP27A1Q02318 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms