Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms