Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BACE1P56817 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BACE1P56817 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BACE1P56817 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BACE1P56817 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BACE1P56817 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BACE1P56817 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BACE1P56817 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BACE1P56817 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BACE1P56817 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BACE1P56817 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BACE1P56817 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BACE1P56817 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BACE1P56817 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BACE1P56817 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BACE1P56817 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BACE1P56817 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms