Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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