Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIRAP54198 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIRAP54198 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIRAP54198 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIRAP54198 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIRAP54198 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIRAP54198 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIRAP54198 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIRAP54198 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIRAP54198 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms