Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms