Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC1P35052 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms