Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms