Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA5P20719 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms