Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFAPP14136 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFAPP14136 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFAPP14136 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFAPP14136 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFAPP14136 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFAPP14136 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFAPP14136 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFAPP14136 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFAPP14136 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFAPP14136 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFAPP14136 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFAPP14136 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFAPP14136 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GFAPP14136 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFAPP14136 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFAPP14136 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFAPP14136 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFAPP14136 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms