Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODC1P11926 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms