Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms