Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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