Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEN1O00255 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MEN1O00255 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MEN1O00255 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEN1O00255 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEN1O00255 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEN1O00255 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEN1O00255 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEN1O00255 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEN1O00255 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEN1O00255 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEN1O00255 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEN1O00255 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MEN1O00255 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MEN1O00255 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MEN1O00255 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MEN1O00255 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MEN1O00255 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MEN1O00255 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MEN1O00255 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
MEN1O00255 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MEN1O00255 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MEN1O00255 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEN1O00255 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEN1O00255 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEN1O00255 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEN1O00255 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEN1O00255 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MEN1O00255 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms