Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms