Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIMS3Q9UJD0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms