Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKIRAS1Q9NYS0 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms