Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXC10Q9NYD6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
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