Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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