Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms