Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CARD11Q9BXL7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms