Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms