Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPIFA3Q9BQP9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms