Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PITX2Q99697 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms