Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPS6KC1Q96S38 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms