Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms