Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms