Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms