Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP9XQ93008 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP9XQ93008 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP9XQ93008 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP9XQ93008 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP9XQ93008 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP9XQ93008 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP9XQ93008 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP9XQ93008 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP9XQ93008 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP9XQ93008 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms