Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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COPS9Q8WXC6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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COPS9Q8WXC6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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COPS9Q8WXC6 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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