Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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