Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L1

KRTCAP2, Keratinocyte-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTCAP2Q8N6L1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTCAP2Q8N6L1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms