Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms