Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LTBP4Q8N2S1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
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