Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWN7

RP1L1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1L1Q8IWN7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RP1L1Q8IWN7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms