Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms