Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM69BQ5VUD6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms