Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms