Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKOR2Q2VWA4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms